2006年高智晟被当局以煽动颠覆国家政权罪判刑3年，缓刑5年。2010年4月，高智晟再次露面，但随即失踪。2011年，高智晟被关进新疆沙雅县监狱。在被捕之前和缓刑期间，高智晟长期遭国保绑架失踪和施以酷刑。他的妻子及两个孩子在2009年逃到美国。
