蕲艾在中医体系里还有一个更大的用途——灸疗。灸疗也称艾灸，是用点燃的艾通过各种方式来刺激人体穴位的一种疗法。常用的穴位有大椎穴，肚脐，足三里，合谷穴等。《本草纲目》中记载“灸之则透诸经，而治百种病邪”。[思考]蕲艾的燃烧放热量比普通艾要高20%以上。这种艾做艾条，它的灸疗效果更好。
