为取回星光失去的记忆，星光需拿回99张名字带有「No.」的超量怪兽卡，因此九十九游马及星光两人开始一起行动。星光出现真正目的是什么？新的怪兽「No.」怪兽的存在到底是何方神圣？面对持续出现在游马面前的强力劲敌，星光身上的谜团也逐渐明朗化。而本故事就是讲述这搭挡缔造的新决斗传说。
