哈佛肯尼迪政府学院是典型的跨学科学院，内部不设以学科划分的系，其科研教学围绕六个政策领域展开。国际和全球事务；国际发展；城市和社会政策；民主、政治和制度；决策科学、管理和领导力；市场、企业和政府。同一政策领域知识结构皆跨学科。如国际发展，既有大量政治类又有经济类的课程。
