草甘膦影响猪和牛肠道正常益生菌但对有害肠道菌落无影响从而造成人畜肉毒杆菌中毒（参考论文：Glyphosate linked to botulism and other animal health problems）。国内有研究者认为，2006年之后国内异常频繁的不明原因的“猪瘟”和死猪抛江事件很可能与采用转基因玉米制造的饲料内含有草甘膦造成的
